1、要注意预热，升温，保温三个步骤，每一步都要注意时间和温度，因为时间和温度直接关系到所要灭菌东西的质量，例如色泽，营养成分的损耗，或者杂菌的灭死率等，和此配套的就是要保证在灭菌的过程中，相关的管道，阀门，法兰，等设备本身要无泄漏。在生物发酵中无菌概念尤为重要。

2、蒸汽压力必须要保持一段时间，一般在15分钟左右，实际上就是延长消毒时间，保证热量穿透入细菌。

3、排气时尽可能快，可使细菌体膨胀破裂。

4、消毒灭菌的载体尽量不要太干燥，湿润的状态有利于溶解细菌的包膜。

5、有条件的，先用其他的消毒措施，最后再用高压蒸汽，可提高效率，并可减少二次污染。